MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 3053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	A	6	6	1	6	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017202	ACA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017202	TGT	2	6	29	34	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017202	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017202	ATAA	2	8	89	96	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017202	GGA	2	6	129	134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017202	TCT	2	6	162	167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183675
8	NC_017202	TAG	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183675
9	NC_017202	CAA	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183675
10	NC_017202	TTG	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183675
11	NC_017202	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	384183675
12	NC_017202	GT	3	6	508	513	0 %	50 %	50 %	0 %	384183675
13	NC_017202	ATA	2	6	520	525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183675
14	NC_017202	TATC	2	8	589	596	25 %	50 %	0 %	25 %	384183675
15	NC_017202	ATGA	2	8	600	607	50 %	25 %	25 %	0 %	384183675
16	NC_017202	TAT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
17	NC_017202	AGG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183675
18	NC_017202	AAC	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183675
19	NC_017202	ATCG	2	8	714	721	25 %	25 %	25 %	25 %	384183675
20	NC_017202	TACAG	2	10	729	738	40 %	20 %	20 %	20 %	384183675
21	NC_017202	TTA	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
22	NC_017202	GTC	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183675
23	NC_017202	TTA	2	6	829	834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
24	NC_017202	CTT	2	6	854	859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183675
25	NC_017202	ACT	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183675
26	NC_017202	A	6	6	971	976	100 %	0 %	0 %	0 %	384183675
27	NC_017202	CTGG	2	8	1198	1205	0 %	25 %	50 %	25 %	384183676
28	NC_017202	GAA	2	6	1278	1283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
29	NC_017202	TCT	2	6	1365	1370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
30	NC_017202	TTA	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
31	NC_017202	CAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183676
32	NC_017202	AAT	2	6	1422	1427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
33	NC_017202	TTC	2	6	1480	1485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
34	NC_017202	TATG	2	8	1490	1497	25 %	50 %	25 %	0 %	384183676
35	NC_017202	AAGCA	2	10	1519	1528	60 %	0 %	20 %	20 %	384183676
36	NC_017202	GTATA	2	10	1547	1556	40 %	40 %	20 %	0 %	384183676
37	NC_017202	A	6	6	1714	1719	100 %	0 %	0 %	0 %	384183676
38	NC_017202	ATG	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
39	NC_017202	CAAA	2	8	1923	1930	75 %	0 %	0 %	25 %	384183676
40	NC_017202	A	6	6	1935	1940	100 %	0 %	0 %	0 %	384183676
41	NC_017202	AGCA	2	8	1957	1964	50 %	0 %	25 %	25 %	384183676
42	NC_017202	A	6	6	1971	1976	100 %	0 %	0 %	0 %	384183676
43	NC_017202	TTA	2	6	1999	2004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
44	NC_017202	GAA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
45	NC_017202	AAC	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183676
46	NC_017202	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
47	NC_017202	CGA	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183676
48	NC_017202	TGAAT	2	10	2267	2276	40 %	40 %	20 %	0 %	384183676
49	NC_017202	ATG	3	9	2350	2358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
50	NC_017202	TAT	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
51	NC_017202	CAT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
52	NC_017202	TGA	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
53	NC_017202	ATG	2	6	2488	2493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
54	NC_017202	TA	3	6	2553	2558	50 %	50 %	0 %	0 %	384183676
55	NC_017202	A	6	6	2603	2608	100 %	0 %	0 %	0 %	384183676
56	NC_017202	AGA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
57	NC_017202	CTT	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
58	NC_017202	CAAT	2	8	2804	2811	50 %	25 %	0 %	25 %	384183676
59	NC_017202	ATG	3	9	2950	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
60	NC_017202	ATC	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
61	NC_017202	CTT	3	9	3037	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
62	NC_017202	TAC	2	6	3179	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
63	NC_017202	CTT	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
64	NC_017202	CAT	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
65	NC_017202	GAA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
66	NC_017202	AC	3	6	3300	3305	50 %	0 %	0 %	50 %	384183676
67	NC_017202	TTG	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183676
68	NC_017202	CTC	2	6	3325	3330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183676
69	NC_017202	T	6	6	3358	3363	0 %	100 %	0 %	0 %	384183676
70	NC_017202	TGG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183676
71	NC_017202	AGA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
72	NC_017202	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
73	NC_017202	TAA	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
74	NC_017202	TAAA	2	8	3643	3650	75 %	25 %	0 %	0 %	384183676
75	NC_017202	CAAT	2	8	3658	3665	50 %	25 %	0 %	25 %	384183676
76	NC_017202	T	6	6	3684	3689	0 %	100 %	0 %	0 %	384183676
77	NC_017202	ATT	2	6	3759	3764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
78	NC_017202	GT	3	6	3775	3780	0 %	50 %	50 %	0 %	384183676
79	NC_017202	TA	3	6	3790	3795	50 %	50 %	0 %	0 %	384183676
80	NC_017202	AGA	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
81	NC_017202	AGA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
82	NC_017202	A	6	6	3998	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017202	T	7	7	4016	4022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017202	AAAAT	2	10	4065	4074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017202	A	6	6	4096	4101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017202	AC	4	8	4131	4138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017202	CTTT	2	8	4179	4186	0 %	75 %	0 %	25 %	384183677
88	NC_017202	ACA	2	6	4214	4219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183677
89	NC_017202	ATA	2	6	4223	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183677
90	NC_017202	TCT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
91	NC_017202	TTC	2	6	4271	4276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
92	NC_017202	AGG	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183677
93	NC_017202	ATC	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183677
94	NC_017202	AGA	2	6	4444	4449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183677
95	NC_017202	ATG	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183677
96	NC_017202	AT	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
97	NC_017202	T	7	7	4711	4717	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
98	NC_017202	GATA	2	8	4749	4756	50 %	25 %	25 %	0 %	384183677
99	NC_017202	CTT	2	6	4797	4802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
100	NC_017202	T	6	6	4877	4882	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
101	NC_017202	T	6	6	4916	4921	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
102	NC_017202	TTTAAT	2	12	4937	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
103	NC_017202	AT	3	6	4953	4958	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
104	NC_017202	TCT	2	6	4991	4996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
105	NC_017202	ATT	2	6	5077	5082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
106	NC_017202	ACCT	2	8	5092	5099	25 %	25 %	0 %	50 %	384183677
107	NC_017202	ACC	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183677
108	NC_017202	AT	3	6	5185	5190	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
109	NC_017202	TCG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183677
110	NC_017202	AATACG	2	12	5233	5244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183677
111	NC_017202	ATA	2	6	5304	5309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183677
112	NC_017202	A	6	6	5313	5318	100 %	0 %	0 %	0 %	384183677
113	NC_017202	T	6	6	5341	5346	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
114	NC_017202	TTA	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
115	NC_017202	T	7	7	5515	5521	0 %	100 %	0 %	0 %	384183677
116	NC_017202	TTC	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
117	NC_017202	A	6	6	5534	5539	100 %	0 %	0 %	0 %	384183677
118	NC_017202	A	6	6	5608	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	384183677
119	NC_017202	AGAA	2	8	5639	5646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017202	T	7	7	5652	5658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017202	TAAAG	2	10	5727	5736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017202	GTTAT	2	10	5759	5768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017202	GTT	2	6	5780	5785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017202	ACA	2	6	5798	5803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017202	AAG	2	6	5812	5817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017202	A	6	6	5848	5853	100 %	0 %	0 %	0 %	384183678
127	NC_017202	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	384183678
128	NC_017202	CGG	2	6	6009	6014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183678
129	NC_017202	AACA	2	8	6193	6200	75 %	0 %	0 %	25 %	384183678
130	NC_017202	CCA	2	6	6262	6267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183678
131	NC_017202	AC	3	6	6365	6370	50 %	0 %	0 %	50 %	384183678
132	NC_017202	AGA	2	6	6384	6389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183678
133	NC_017202	TAA	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017202	AGG	2	6	6549	6554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017202	TA	3	6	6592	6597	50 %	50 %	0 %	0 %	384183679
136	NC_017202	T	6	6	6643	6648	0 %	100 %	0 %	0 %	384183679
137	NC_017202	AGA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183679
138	NC_017202	AGG	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183679
139	NC_017202	AG	3	6	6737	6742	50 %	0 %	50 %	0 %	384183679
140	NC_017202	TAA	2	6	6768	6773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183679
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414	NC_017202	ATC	2	6	19866	19871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183691
415	NC_017202	GAA	2	6	19944	19949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
416	NC_017202	ATG	2	6	20018	20023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
417	NC_017202	AGC	2	6	20145	20150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_017202	TCA	2	6	20165	20170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_017202	CT	3	6	20216	20221	0 %	50 %	0 %	50 %	384183692
420	NC_017202	TCG	3	9	20317	20325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183692
421	NC_017202	AGT	2	6	20412	20417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183692
422	NC_017202	CAGT	2	8	20427	20434	25 %	25 %	25 %	25 %	384183692
423	NC_017202	TTA	2	6	20451	20456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183692
424	NC_017202	TCT	2	6	20529	20534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183692
425	NC_017202	GAA	2	6	20551	20556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183692
426	NC_017202	TCGGT	2	10	20569	20578	0 %	40 %	40 %	20 %	384183692
427	NC_017202	TCT	2	6	20643	20648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183692
428	NC_017202	GTC	2	6	20691	20696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183692
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430	NC_017202	AAT	2	6	20975	20980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183692
431	NC_017202	TGT	2	6	20982	20987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183692
432	NC_017202	ATT	2	6	21026	21031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183692
433	NC_017202	CGT	2	6	21056	21061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183692
434	NC_017202	TAC	2	6	21169	21174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183692
435	NC_017202	TGGT	2	8	21253	21260	0 %	50 %	50 %	0 %	384183692
436	NC_017202	TTC	2	6	21277	21282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183692
437	NC_017202	CCT	2	6	21524	21529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183692
438	NC_017202	TCC	2	6	21565	21570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
439	NC_017202	TGC	2	6	21581	21586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_017202	TAC	2	6	21601	21606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_017202	TTC	2	6	21683	21688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_017202	TC	3	6	21728	21733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
443	NC_017202	CGC	2	6	21739	21744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_017202	CCG	2	6	21752	21757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_017202	TTG	2	6	21795	21800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NC_017202	GGAGT	2	10	21966	21975	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017202	AT	3	6	22103	22108	50 %	50 %	0 %	0 %	384183693
448	NC_017202	T	6	6	22156	22161	0 %	100 %	0 %	0 %	384183693
449	NC_017202	CTC	2	6	22204	22209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183693
450	NC_017202	TA	4	8	22330	22337	50 %	50 %	0 %	0 %	384183693
451	NC_017202	GTTTT	2	10	22356	22365	0 %	80 %	20 %	0 %	384183693
452	NC_017202	TA	3	6	22392	22397	50 %	50 %	0 %	0 %	384183693
453	NC_017202	ATAA	2	8	22422	22429	75 %	25 %	0 %	0 %	384183693
454	NC_017202	CAA	2	6	22591	22596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183693
455	NC_017202	TCC	2	6	22639	22644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183693
456	NC_017202	GAA	2	6	22724	22729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183693
457	NC_017202	GTA	2	6	22778	22783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183693
458	NC_017202	AAG	2	6	22796	22801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183693
459	NC_017202	TAA	2	6	22846	22851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183693
460	NC_017202	AG	3	6	22892	22897	50 %	0 %	50 %	0 %	384183693
461	NC_017202	GTA	2	6	22898	22903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183693
462	NC_017202	TTG	2	6	22909	22914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183693
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464	NC_017202	AT	3	6	23018	23023	50 %	50 %	0 %	0 %	384183693
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466	NC_017202	A	6	6	23077	23082	100 %	0 %	0 %	0 %	384183693
467	NC_017202	GATG	2	8	23159	23166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017202	TG	3	6	23165	23170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017202	AAG	2	6	23197	23202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
470	NC_017202	ATTA	2	8	23258	23265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017202	ATA	3	9	23282	23290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017202	ATATT	2	10	23296	23305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017202	TAC	2	6	23357	23362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_017202	TTC	2	6	23373	23378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_017202	TAT	2	6	23439	23444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_017202	TAA	2	6	23511	23516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_017202	AAATA	2	10	23536	23545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_017202	A	7	7	23582	23588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_017202	A	7	7	23604	23610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017202	TTCT	2	8	23616	23623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
481	NC_017202	T	6	6	23648	23653	0 %	100 %	0 %	0 %	384183694
482	NC_017202	TGA	2	6	23665	23670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183694
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484	NC_017202	AGTA	2	8	23762	23769	50 %	25 %	25 %	0 %	384183694
485	NC_017202	ACG	2	6	23822	23827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183694
486	NC_017202	TCA	2	6	23874	23879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183694
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489	NC_017202	ACA	2	6	23929	23934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183694
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492	NC_017202	CGTATT	2	12	24011	24022	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384183694
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494	NC_017202	TTCATA	2	12	24147	24158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183694
495	NC_017202	ACA	2	6	24172	24177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183694
496	NC_017202	TG	3	6	24198	24203	0 %	50 %	50 %	0 %	384183694
497	NC_017202	AT	3	6	24271	24276	50 %	50 %	0 %	0 %	384183694
498	NC_017202	CTA	2	6	24292	24297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183694
499	NC_017202	TC	3	6	24300	24305	0 %	50 %	0 %	50 %	384183694
500	NC_017202	AC	3	6	24318	24323	50 %	0 %	0 %	50 %	384183694

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